产品特性:正版授权 | 软件名称:SeqMan | 版本语言:简体中文版 |
软件类型:序列组装软件应用程序 | 版本号:***版 | 系统平台要求:Windows |
系统硬件要求:8GB | 版权:正版授权 | 配套附件:显卡 |
技术支持:安装 | 版本类型:企业版、 正式版、 教育版 |
SeqMan Ultra是SeqMan Pro的新面孔,这是我们长期以来的序列组装软件应用程序,拥有全新的现代直观界面,并在引擎盖下进行了大量性能改进。SeqMan Ultra为Sanger序列组装使用了很准确的重叠群组装算法,并为Sanger和NGS组装提供了广泛的组装后分析工具。与竞争对手相比,我们的算法在将桑格序列组装成单个重叠群方面做得较好,并根据轨迹质量和形状调用准确的一致序列。组装后,SeqMan Ultra独特地为您提供了轻松编辑组装数据的能力——暴露或修剪末端、引入突变——以及分析组装数据,包括查看色谱图、评估覆盖率、分析变体,以及检查单个重叠群中组织的多个样本。
SeqMan Ultra相关工作流
桑格序列组件:对装配的准确性充满信心。
桑格序列4个简单步骤组装——
步骤1:输入读数和参考序列(如果使用),并设置自动质量和矢量修剪
步骤2:(可选)预览色谱图并手动修剪末端
步骤3:运行组件
步骤4:分析程序集,包括评估覆盖范围和冲突
临床研究
用于人类基因组分析的激光基因基因组学临床研究工作流程:
设置:输入读取、BED/VCF文件,并选择人工或鼠标模板包
组装并识别变体:SeqMan NGen汇编测序数据并自动识别、注释和分析变体
比较样本:创建和比较变量集,应用统计过滤器
分析基因:轻松找到与变体集相交的基因并分析基因本体
De Novo基因组组装
4个简单步骤的De Novo基因组组装
步骤1:***部件的顺序和参数
步骤2:检查冲突并评估覆盖范围
步骤3:将重叠组组装成支架
步骤4:添加序列以缩小差距
宏基因组组装
使用Lasergene Genomics强大的算法将宏基因组序列数据与不同的参考数据集对齐,或对新序列进行聚类以进行鉴定。
宏基因组学4个简单步骤组装
步骤1:设置并运行宏基因组程序集
步骤2:识别样本中丰富的菌株
步骤3:分析变体并评估覆盖范围
步骤4:可视化细 菌菌株的相对丰度
变量分析
4个简单步骤中的变量分析
步骤1:设置并运行组件
步骤2:比较多个数据集的变体
步骤3:筛选以查找感兴趣的变体
步骤4:查看路线内的变体
病毒基因组分析
4个简单步骤的病毒基因组测序分析
步骤1:在SeqMan Ultra中针对参考序列组装单个或多个病毒样本
步骤2:评估变体并导出感兴趣样本的一致序列
步骤3:在MegAlign Pro中将大组共有序列与已知菌株比对
步骤4:分析统计数据并识别路线中的变体
全基因组/外显子组测序
4个简单步骤的全外显子组/全基因组序列分析
步骤1:将数据与基因组模板对齐
步骤2:识别和比较感兴趣的变体
步骤3:分析注释数据上下文中的变体并读取对齐
步骤4:同时评估所有样品的装配覆盖率